Anvisa e Conitec têm funções diferentes. A agência sanitária avalia qualidade, segurança e eficácia para autorizar a comercialização. Para que um medicamento passe a ser oferecido pelo SUS, é necessária uma avaliação específica da Comissão Nacional de Incorporação de Tecnologias no Sistema Único de Saúde (Conitec), que considera, além das evidências clínicas, a comparação com as terapias já disponíveis e a relação entre custos e benefícios.
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