Na maioria das vezes, porém, esses medicamentos nunca eliminam completamente o vírus. O HIV ainda estabelece reservatórios em vários tecidos, incluindo sangue, linfonodos, cérebro e intestinos, o que lhe permite permanecer em estado latente por muitos anos, frequentemente sofrendo mutações para impedir que as células imunológicas o encontrem e o destruam.
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